Đối với Bảo tàng Văn hóa Sa Huỳnh, Văn hóa Dân gian, Nghề y Truyền thống, cán bộ nghiệp vụ đã tập trung xử lý phòng ngừa côn trùng xâm hại hiện vật, bổ sung nội dung giới thiệu, êtiket hiện vật. Ngoài ra, việc xây dựng kế hoạch nâng cấp tại Bảo tàng Văn hóa Dân gian và Bảo tàng Gốm sứ Mậu dịch cũng được tập trung hoàn thiện. Hai điểm bảo tàng này sẽ nâng cấp không gian trải nghiệm, xây dựng hoạt động tương tác với công chúng để các bảo tàng thực sự thu hút và hấp dẫn du khách khi đến với Hội An nói chung và bảo tàng nói riêng.
Ngoài những hoạt động chuyên môn hàng ngày tại điểm bảo tàng, di tích, công tác an ninh, an toàn hiện vật cũng được đặt lên hàng đầu. Tất cả các điểm bảo tàng, di tích đều có trực bảo vệ 24/24 và hệ thống camera được bố trí tất cả các điểm hỗ trợ công tác bảo vệ hiện vật.
Với sự quan tâm của lãnh đạo Trung tâm cùng với sự nỗ lực của cán bộ chuyên môn, thời gian đến các bảo tàng chuyên đề ở Hội An sẽ có nhiều thay đổi để đáp ứng thị hiếu của du khách trong và ngoài nước.