Di tích là nơi thờ cúng những người có công trong việc sáng lập và phát triển nghề khai thác tổ chim yến của làng Thanh Châu và các vị thần bảo hộ của nghề. Trải qua thời gian sử dụng, di tích bị xuống cấp và đã được UBND thành phố Hội An thống nhất chủ trương tu bổ. Sau hơn 2 tháng thi công tu bổ, đầu tháng 4/2017, công trình tu bổ di tích Yến Nghệ tổ miếu được hoàn thành. Chiều ngày 14/4, Trung tâm Quản lý Bảo tồn Di sản Văn hóa Hội An đã phối hợp với các ban ngành thành phố, UBND xã Cẩm Thanh tổ chức bàn giao đưa vào sử dụng di tích nhằm đáp ứng nhu cầu sinh hoạt văn hóa tín ngưỡng của cộng đồng nhân dân địa phương. Tổng mức đầu tư tu bổ di tích là 448.325.000 đồng, từ nguồn ngân sách của Tỉnh và thành phố Hội An. Việc tu bổ hoàn thành di tích góp phần bảo tồn, phát huy các giá trị di sản văn hóa Hội An.